sed

SED поступает правильно (по виндовым меркам) - он на символе КОНЕЦ-ФАЙЛА прекращает работу (вернее это библиотека В/В сообщает о EOF). Вроде как ключа ДВОИЧНЫЙ-ВВОД у СЕДа нету. Так что помочь тебе может например tr:

tr \x1A Я <input.log | sed ... | tr Я \x1A >result

Еще проще - залещь в сорсы sed и поставь ему двоичный режим - но тогда надо с CR-ами бороться

Аркадий